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Des tests rapides au service de la science : une nouvelle méthode pour surveiller les épidémies en Guinée

Dans un monde confronté à des crises sanitaires récurrentes, la surveillance génomique des virus joue un rôle crucial pour prévenir et contrôler les épidémies. En Guinée, où l’accès aux infrastructures de biologie moléculaire est souvent limité, une étude innovante ouvre de nouvelles perspectives. Dr Alpha Kabiné Keita, doctorant en microbiologie et chercheur au Centre de Recherche et de Formation en Infectiologie de Guinée (CERFIG), a publié des travaux révolutionnaires dans la revue scientifique BMC sur l’utilisation des tests de diagnostic rapide (TDR) pour la collecte d’échantillons destinés à la surveillance génomique.

Une solution innovante pour des zones rurales sous-représentées

La recherche scientifique actuelle souffre souvent d’un déséquilibre dans la collecte des données, particulièrement en milieu rural. Selon Dr Keita, « Les méthodes traditionnelles de prélèvement et de transport des échantillons pour la surveillance génomique sont coûteuses, complexes, et dépendent d’une chaîne de froid difficile à maintenir. » Cela limite la capacité à surveiller efficacement des virus comme le SARS-CoV-2, responsable de la COVID-19.

L’étude du CERFIG propose d’utiliser les cassettes des TDR, déjà répandues dans les centres de santé, comme source d’acide ribonucléique (ARN) pour des analyses génomiques. Cette approche permettrait de contourner les problèmes de logistique et de coûts sans nécessiter de double prélèvement. « Le même échantillon prélevé pour un TDR peut être utilisé pour des analyses supplémentaires, évitant ainsi des contraintes inutiles pour les patients », explique Dr Keita.

Comparaison des méthodes

Dans la méthode traditionnelle, un patient testé positif avec un TDR est soumis à un nouveau prélèvement, qui doit ensuite être transporté dans des conditions de température strictes. En l’absence de chaîne de froid, la qualité des échantillons se dégrade, compromettant la fiabilité des résultats.

« Les cassettes TDR, en revanche, peuvent être transportées à température ambiante sans impact sur l’intégrité des échantillons, précise Dr Keita. Cela permet d’étendre la surveillance génomique à des zones isolées avec un minimum d’infrastructure. » Il ajoute que cette solution minimise également les frais liés aux kits de prélèvement spécialisés et aux dispositifs de réfrigération.

Des bénéfices économiques et pratiques

En recourant aux TDR pour échantillonner les analyses de surveillance génomique, les scientifiques peuvent diagnostiquer plus rapidement et plus efficacement, tout en permettant un meilleur accès à l’information en milieu rural. Les résultats démontrent que les PCR effectuées sur les échantillons issus des TDR ont une sensibilité et une spécificité comparables aux méthodes classiques. « Intégrer cette stratégie dans les programmes de surveillance existants serait un changement de paradigme dans la réponse aux épidémies, selon Dr Keita, une démarche qu’il faut cependant coupler à une coordination avec les autorités sanitaires, les organisations de santé, et les acteurs de la communauté pour maximiser les ressources disponibles. » Une nouvelle approche prometteuse pour la surveillance des maladies. Cette stratégie applicable à d’autres maladies endémiques pourrait également être utilisée pour le paludisme ou la dengue qui font déjà l’objet de tests rapides en Guinée. Les agents de santé communautaires peuvent en effet se voir confier la récupération des cassettes TDR et leur transport au centre de référence pour des analyses complémentaires.

Un avenir prometteur pour la surveillance des maladies

Cette nouvelle approche pourrait être appliquée à d’autres maladies endémiques, telles que le paludisme ou la dengue, qui font déjà l’objet de tests rapides en Guinée. Les agents de santé communautaires, familiarisés avec l’utilisation des TDR, pourraient jouer un rôle clé dans la collecte et l’acheminement des cassettes vers des centres de référence pour des analyses approfondies.

L’utilisation des cassettes TDR pour la surveillance génomique offre une solution pratique, économique et largement accessible. Elle constitue une avancée significative vers une meilleure réponse aux épidémies, tout en renforçant les capacités des systèmes de santé au niveau local.

Alpha Oumar Bagou Barry

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